質問をします・・・・

「新しいファイル・ディスクリプタはargに与えられた値以上の有効な値が与え
られます。」と書いてありますが、この意味がわかりません、どういう意味か
わかりすか？何か例で示していただければありがたいのですが・・・

F_GETFD 　   close-on-exec**フラグを最下位ビットに得ます。 ←　セットすると
いう意味ではないのですか？ちょっとわからないです。
              　　戻り値：最下位bitが0・・・実行中はファイルをオープンしたま
まです。

F_SETFD      close-on-execフラグを設定します。　←　こちらはセットするみたい
ですね、となると上記のは何ですかね・・・
　　　　　　　　 argの最下位bitに1(セット)または0(クリア)を設定します。←こ
れもどういう状態かわかりませんね

F_GETFL       ファイル・ステータス・フラグ**を戻り値として得ます。

 F_SETFL       ファイル・ステータス・フラグをargで設定します。←どのように設
定するのですか？




概要　ファイル・コントロール

　ファイル・ディスクリプタ　fcntlの操作を指定するコマンド
               ↓　　　　　　↓
int fcntl(int fildes , int cmd , arg);
 ↑　　　　　　　　　　　　　　　　↑
コール成功・・・後述　　　　　　パラメータ　
コール失敗・・・-1

説明
○各cmdとfcntlの戻り値との関係は次のとおりです。
　F_DUPFD ファイル・ディスクリプタを複製して、新しいファイル・ディスクリプタ
を
　　　　　　　　戻り値に返します。
　　　　　　　　新しいファイル・ディスクリプタはargに与えられた値以上の有効
な値が与え
　　　　　　　　られます。
  対象のファイルはオリジナルのファイルと同じものです。
  次のものはそのままコピーされます。
  　-ファイルリード/ライトポインタ
  　-アクセスモード
  　-ファイル・ステータス・フラグ*

　F_GETFD close-on-exec**フラグを最下位ビットに得ます。
  戻り値：最下位bitが0・・・実行中はファイルをオープンしたままです。

　F_SETFD       close-on-execフラグを設定します。
　　　　　　　　argの最下位bitに1(セット)または0(クリア)を設定します。

　F_GETFL       ファイル・ステータス・フラグ**を戻り値として得ます。

  F_SETFL       ファイル・ステータス・フラグをargで設定します。

　F_DUPFD等は<fcntl.h>に定義されてます。

　F_SETFD,F_SETFLによる設定はファイルがopenされている間だけ有効です。　

ご指導よろしくお願いします。

$ cat file
abcdefghijklmnopqrstuvwxyz
$ cat a.c
#include <unistd.h>
#include <fcntl.h>
#include <stdio.h>

int main(void)
{
    int fd1, fd2, n;  char buf[16];

    fd1 = open("file", O_RDONLY);
    n = read(fd1, buf, 12);
    printf("fd1=%d, buf=[%.*s]\n", fd1, n, buf);
    fd2 = fcntl(fd1, F_DUPFD, 6);
    n = read(fd2, buf, 12);
    printf("fd2=%d, buf=[%.*s]\n", fd2, n, buf);
    close(fd2);
    close(fd1);
    return 0;
}
$ gcc a.c
$ ./a.out
fd1=3, buf=[abcdefghijkl]
fd2=6, buf=[mnopqrstuvwx]
$

fcntl(fd1, F_DUPFD, 6) は、4 や 5 が空いているのに 6 を返します。
もし、6 が既に使われていたら、7 を返すでしょう。

他にも質問があったようですね。

#include <unistd.h>
#include <fcntl.h>
#include <stdio.h>

int main(void)
{
    int fd, flag;

    fd = open("file", O_RDONLY);
    flag = fcntl(fd, F_GETFL);
    printf("flag=%o\n", flag);
    flag = fcntl(fd, F_GETFD);
    printf("close-on-exec=%d\n", flag & 1);
    fcntl(fd, F_SETFD, 1);
    flag = fcntl(fd, F_GETFD);
    printf("close-on-exec=%d\n", flag & 1);
    flag = fcntl(fd, F_GETFL);
    printf("flag=%x\n", flag);
    close(fd);
    return 0;
}

open で O_RDONLY しか指定していないから、最後の flag の値は 0 かな？