for(i=0;i<20;i++){
        for(j=0;j<20;j++){
            fscanf(fp,"%d",&a[i][j]);
        }
    }

   fscanf( fp, "%05d", &n );

   fscanf( fp, "%05d", &n );

サンプルプログラムはサンプルプログラムとして、鵜呑みにするのではなく、
自分のやりたい内容に落とし込む努力は必要です。

さて、数字を1型ずつ取り込みたいのなら、
fscanf(fp, "%1d", &a[i][j]);
といった具合になるかと思います。

いずれにしろ、どんな結果を求めているのかがみえないので
あなたが求める回答に直接結びつく確率は低いでしょう。

それから、ファイルの読み込みは、fgets() で1行読み込み、
sscanf()で読み込んだ文字列を解析するのが常套手段だと言われています。

char buf[57] ;

for( r= 0 ; r < 20 ; r++ ){
    fgets(buf,sizeof buf, fp);
    for( c= 0 ; c < 56 ; c++ ){
        /* 一文字の処理 */
    }
}


説明するのなら、事実だけを書けばいいと思いますが・・・

・ファイには、２０名のシフトの値が格納されている。
・各行は、社員（ぱーと？）一人分の５６日間のシフト値が入っている。
・シフト一日の値は数字１文字で表され、行中に数字以外の文字は現れない。
（行末の改行は考えない）

例

22222330000033000003300000330000033000003300000330000033
22222330000033000003300000330000033000003300000330000033
22222330000033000003300000330000033000003300000330000033
00000332222233000003300000330000033000003300000330000033

「このような表があった場合、該当ファイルから（人、日を次元とした）
二次元配列に、各人・各日のシフト値を読み込みたいと思っている」

e.g.
 buf[0][0] == '2'
 buf[0][5] == '3'

上のレス、インデント消えてますね… ｶｯｺﾜﾘｨ

char data[20][58];
for(ix=0;ix<20;ix++)
  fgets( data[ix], sizeof(data[ix]), stream );

fgets の場合だと、\r\n の分も考慮しないと、
取得結果がグダグダになりますね。