#include<stdio.h>
char henkan(char,int);

void main(void)
{
int i;
char tako[64],takos[64];

printf("半角英数で６３文字以内の文字列を入力してください：");
scanf("%s",tako);

takos[i]= henkan(tako[i],i);

printf("%s",takos);
}

char henkan(char tako,int i)
{ 
for(i=0;i<64;i++){
if(i>='A' && i<='Z')
    return(i+'a'-'A');
else if(i>='a' && i<='z')
    return(i+'A'-'a');
}
}

余計なコメントをして混乱させてしまったかも知れないので、お詫びに：
次のhenkan関数は、アルファベット１文字の大文字小文字を変換します。
ASCIIキャラクタセットであることが前提です。

#include<stdio.h>

#define SIZE 64

char henkan( char c )
{
    if( 'A' <= c && c <= 'Z' ){
        return c + 'a' - 'A';
    }
    if( 'a' <= c && c <= 'z' ){
        return c + 'A' - 'a';
    }
    return c;
}

void main(void)
{
    char tako[SIZE], takos[SIZE];
    int i;

    printf( "半角英数で%d文字以内の文字列を入力してください：\n", SIZE - 1 );
    scanf( "%s\n", tako );

    for( i = 0; i < SIZE - 1 && tako[i] != '\0'; i++ ){
        takos[i] = henkan( tako[i] );
    }
    takos[i] = '\0';

    printf("%s\n",takos );
}

#include<stdio.h>
char henkan(char);

void main(void)
{
int i;
char tako[64],takos[64];

printf("半角英数で６３文字以内の文字列を入力してください：");
scanf("%s",tako);

for(i = 0; i <= 63 && tako[i] !='\0';i++){
takos[i]= henkan(tako[i]);
}
printf("%s",takos);
}

char henkan(char a)
{ 
if(a>='A' && a<='Z'){
    return a+'a'-'A';
}
else if(a>='a' && a<='z'){
    return a+'A'-'a';
}
return a;
}